Amniosentez gebelik sırasında bebeği saran amnion sıvısından örnek alma işlemidir. Amniosentezin en sık yapılma nedeni Down sendromu gibi kromozom hastalıkları ve bazı genetik hastalıkların tanısını koymaktır. Genetik hastalıkların dışında bebeği etkileyebilecek enfeksiyonların, bebeğin akciğer olgunluğunun değerlendirilmesi amacıylada uygulanabilmektedir. Amniosentez 15. gebelik haftasından sonra uygulanabilir. Amniosentez işleminde ilk etap ultrason ile fetüs, amnion sıvı ve plasentanın belirlenmesidir. Takiben işlem yapılacak bölge temizlenir. Ultrason kılavuzluğu eşliğinde iğne güvenli bir şekilde amnion sıvısına ulaştırılır ve az miktarda amnion sıvısı(yaklaşık 30 cc) örnek amaçlı alınır. Alınan amnion sıvının çoğu bebeğin idrarından oluşmaktadır ve bu yüzden kalan sıvı birkaç saat içinde bebeğin işemesi ile tekrar eski miktarına döner. İşlem süresi kısa olup genellikle 1 dakikayı geçmez. İşlem sırasında anestezi ve sonrasında antibiyotik kullanımı gerekmemektedir. Amnion sıvı örneği laboratuvara gönderildikten sonra Down sendromu ve diğer major koromozom anomalileri için sonuçlar genellikle 3 gün içinde çıkmaktadır. Nadir görülen anomaliler için sonuçların çıkması 3 haftayı bulmaktadır. Nadiren laboratuvar sonuç veremeyebilir. Bu durumda girişim tekrarı gerekebilir.

Amniosentez sonrası ilk birkaç günde hafif kramp tarzında ağrı, az miktarda vajinal kanama ve su gelişi olabilir. Bu durumlar bazı hastalarda gözlenebilmekte olup bu gebeliklerin büyük bir çoğunluğunda gebelik sorunsuz devam eder. Ancak su gelişi ve/veya kanamanın devam etmesi, saatler süren şiddetli kramplar ve 38 derece üstü ateş varlığında hekim ile irtibata geçilmelidir. Amniosentez sonrası komplikasyon riski azda olsa mevcuttur. Bu komplikasyonlar su gelişi, enfeksiyon, düşük(1/300-1/500) olup tecrübeli kişilerce yapıldığında bu olasılık azalmaktadır.